文件存储子系统是基本文件管理系统的核心组成部分，负责管理文件的物理存储和访问。它提供了对文件的读取、写入、修改和删除等基本操作，以及对文件夹的创建、删除和重命名等管理功能。

文件权限子系统用于管理文件的权限控制，包括文件的读、写、执行权限和文件所有者、用户组等属性。它通过访问控制列表或者访问权限位来定义文件的权限，以保护文件的安全性和隐私。

文件传输子系统用于文件的传输和共享，以实现不同计算机之间的文件互通。它提供了文件上传、下载和共享功能，以及文件传输的安全加密和传输速度优化等特性。